Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIL1P09327 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIL1P09327 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VIL1P09327 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIL1P09327 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VIL1P09327 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIL1P09327 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VIL1P09327 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VIL1P09327 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VIL1P09327 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIL1P09327 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VIL1P09327 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VIL1P09327 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VIL1P09327 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VIL1P09327 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VIL1P09327 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIL1P09327 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIL1P09327 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIL1P09327 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIL1P09327 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VIL1P09327 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIL1P09327 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIL1P09327 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VIL1P09327 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VIL1P09327 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VIL1P09327 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VIL1P09327 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIL1P09327 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIL1P09327 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIL1P09327 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIL1P09327 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIL1P09327 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIL1P09327 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIL1P09327 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIL1P09327 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIL1P09327 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIL1P09327 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VIL1P09327 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIL1P09327 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIL1P09327 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms