Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT16P08779 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT16P08779 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT16P08779 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT16P08779 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT16P08779 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT16P08779 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT16P08779 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT16P08779 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT16P08779 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT16P08779 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT16P08779 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT16P08779 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms