Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEFLP07196 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEFLP07196 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEFLP07196 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEFLP07196 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEFLP07196 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEFLP07196 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEFLP07196 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEFLP07196 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEFLP07196 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEFLP07196 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEFLP07196 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEFLP07196 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEFLP07196 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEFLP07196 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEFLP07196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEFLP07196 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEFLP07196 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEFLP07196 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEFLP07196 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEFLP07196 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEFLP07196 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEFLP07196 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NEFLP07196 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEFLP07196 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms