Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1P05023 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1P05023 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms