Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2P04141 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2P04141 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2P04141 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2P04141 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2P04141 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2P04141 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2P04141 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2P04141 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2P04141 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2P04141 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2P04141 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2P04141 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2P04141 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms