Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM1O75626 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRDM1O75626 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PRDM1O75626 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM1O75626 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM1O75626 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRDM1O75626 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM1O75626 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM1O75626 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM1O75626 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM1O75626 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM1O75626 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM1O75626 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM1O75626 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM1O75626 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRDM1O75626 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM1O75626 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM1O75626 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM1O75626 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM1O75626 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms