Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC47.59■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.58■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
ABCC9O60706 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.47■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.19
ABCC9O60706 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC47.44■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC47.44■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC47.38■■■■■ 5.18
ABCC9O60706 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC47.37■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC47.36■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
ABCC9O60706 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms