Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX6O43752 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STX6O43752 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX6O43752 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX6O43752 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX6O43752 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STX6O43752 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX6O43752 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX6O43752 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX6O43752 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX6O43752 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STX6O43752 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX6O43752 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
STX6O43752 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STX6O43752 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX6O43752 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX6O43752 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STX6O43752 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX6O43752 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX6O43752 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX6O43752 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms