Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3QQQ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3QQQ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3QQQ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3QQQ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3QQQ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3QQQ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms