Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms