Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms