Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B8ZZF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B8ZZF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B8ZZF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B8ZZF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B8ZZF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B8ZZF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B8ZZF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B8ZZF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B8ZZF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
B8ZZF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B8ZZF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B8ZZF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B8ZZF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B8ZZF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B8ZZF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B8ZZF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B8ZZF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B8ZZF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms