Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-2B6SEH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-2B6SEH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
ERVV-2B6SEH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVV-2B6SEH9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms