Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP69A5D8W1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP69A5D8W1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms