Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM223A0PJW6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms