Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXY3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXY3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms