Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.129e-8■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 KDM4A-205ENST00000485249 852 ntTSL 36□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 DOCK10-208ENST00000474102 663 ntTSL 22.62□□□□□ -1.991e-6■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 524.86■■□□□ 1.574e-7■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 224.35■■□□□ 1.494e-7■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.267e-7■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 411.42□□□□□ -0.587e-7■■□□□ 14.5
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.73e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 523.5■■□□□ 1.359e-7■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.263e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 13e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.839e-7■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-203ENST00000517489 631 ntTSL 215.36■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 03e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-211ENST00000521726 1129 ntTSL 315.01□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-208ENST00000521112 573 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-208ENST00000486554 576 ntTSL 213.01□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-206ENST00000518850 614 ntTSL 212.68□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-207ENST00000520998 747 ntTSL 212.68□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-217ENST00000560570 2321 ntTSL 211.6□□□□□ -0.553e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-211ENST00000559085 2538 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 TSC22D3-216ENST00000514426 569 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-205ENST00000518164 1128 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 RPL30-209ENST00000521291 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 MEIS2-227ENST00000607277 705 ntTSL 37.89□□□□□ -1.153e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 AHCTF1-206ENST00000483900 3451 ntTSL 22.26□□□□□ -2.053e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.5□□□□□ -2.173e-6■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 CLK2-207ENST00000497188 2702 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-10■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 SNHG10-203ENST00000554169 981 ntTSL 212.31□□□□□ -0.448e-10■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.921e-323■■□□□ 14.4
DGCR8Q8WYQ5 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.226e-12■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.296e-12■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 36.27□□□□□ -1.416e-12■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.416e-12■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.43■■□□□ 1.55e-7■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 411.33□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 48.8□□□□□ -12e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 47.96□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 57.56□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 46.56□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.58□□□□□ -1.21e-8■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 53.37□□□□□ -1.872e-15■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 52.84□□□□□ -1.952e-15■■□□□ 14.3
DGCR8Q8WYQ5 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 314.81□□□□□ -0.045e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 223.3■■□□□ 1.329e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.229e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 217.49■□□□□ 0.397e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 517.29■□□□□ 0.367e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 415.45■□□□□ 0.067e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 315.42■□□□□ 0.067e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 414.56□□□□□ -0.087e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 512.9□□□□□ -0.347e-13■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.217e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.827e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.117e-8■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 317.16■□□□□ 0.341e-6■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 320.07■□□□□ 0.83e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-212ENST00000456058 572 ntTSL 419.3■□□□□ 0.683e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 319.28■□□□□ 0.683e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 318.86■□□□□ 0.613e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 218.34■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 218.3■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-210ENST00000445723 588 ntTSL 417.82■□□□□ 0.443e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.33e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 14.1
DGCR8Q8WYQ5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■■□□□ 14.1
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 212.4 ms