RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562171.1

NFATC3-210, Transcript of nuclear factor of activated T cells 3, humanhuman

TSL 3

Gene NFATC3, Length 707 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFATC3-210ENST00000562171 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.92■■■■■ 5.9
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NFATC3-210ENST00000562171 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.89■■■■■ 4.62
NFATC3-210ENST00000562171 NACADO15069 1562 aa43.71■■■■■ 4.59
NFATC3-210ENST00000562171 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.62■■■■■ 4.57
NFATC3-210ENST00000562171 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.28■■■■■ 4.52
NFATC3-210ENST00000562171 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
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NFATC3-210ENST00000562171 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.89■■■■■ 4.46
NFATC3-210ENST00000562171 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
NFATC3-210ENST00000562171 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.65■■■■■ 4.42
NFATC3-210ENST00000562171 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.61■■■■■ 4.41
NFATC3-210ENST00000562171 SCRIBQ14160 1630 aa42.28■■■■■ 4.36
NFATC3-210ENST00000562171 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.08■■■■■ 4.33
NFATC3-210ENST00000562171 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
NFATC3-210ENST00000562171 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.47■■■■■ 4.23
NFATC3-210ENST00000562171 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.29■■■■■ 4.2
NFATC3-210ENST00000562171 SMARCA4P51532 1647 aa40.38■■■■■ 4.06
NFATC3-210ENST00000562171 NCAPD3P42695 1498 aa40.37■■■■■ 4.05
NFATC3-210ENST00000562171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.32■■■■■ 4.04
NFATC3-210ENST00000562171 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
NFATC3-210ENST00000562171 SMARCA2P51531 1590 aa40.22■■■■■ 4.03
NFATC3-210ENST00000562171 HMGXB3Q12766 1538 aa40.1■■■■■ 4.01
NFATC3-210ENST00000562171 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.02■■■■■ 4
NFATC3-210ENST00000562171 PEG3Q9GZU2 1588 aa40■■■■□ 3.99
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NFATC3-210ENST00000562171 NESP48681 1621 aa39.58■■■■□ 3.93
NFATC3-210ENST00000562171 WIZO95785 1651 aa39.55■■■■□ 3.92
NFATC3-210ENST00000562171 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
NFATC3-210ENST00000562171 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.37■■■■□ 3.89
NFATC3-210ENST00000562171 CUX2O14529 1486 aa39.35■■■■□ 3.89
NFATC3-210ENST00000562171 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.17■■■■□ 3.86
NFATC3-210ENST00000562171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.13■■■■□ 3.85
NFATC3-210ENST00000562171 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
NFATC3-210ENST00000562171 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.06■■■■□ 3.84
NFATC3-210ENST00000562171 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
NFATC3-210ENST00000562171 CFTRP13569 1480 aa38.82■■■■□ 3.81
NFATC3-210ENST00000562171 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.79■■■■□ 3.8
NFATC3-210ENST00000562171 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.76■■■■□ 3.8
NFATC3-210ENST00000562171 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.72■■■■□ 3.79
NFATC3-210ENST00000562171 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.71■■■■□ 3.79
NFATC3-210ENST00000562171 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.66■■■■□ 3.78
NFATC3-210ENST00000562171 WDR62O43379 1518 aa38.64■■■■□ 3.78
NFATC3-210ENST00000562171 PRDM2Q13029 1718 aa38.43■■■■□ 3.74
NFATC3-210ENST00000562171 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
NFATC3-210ENST00000562171 TOPBP1Q92547 1522 aa38.04■■■■□ 3.68
NFATC3-210ENST00000562171 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
NFATC3-210ENST00000562171 ABCC8Q09428 1581 aa37.98■■■■□ 3.67
NFATC3-210ENST00000562171 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.93■■■■□ 3.66
NFATC3-210ENST00000562171 IFT140Q96RY7 1462 aa37.92■■■■□ 3.66
NFATC3-210ENST00000562171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
NFATC3-210ENST00000562171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
NFATC3-210ENST00000562171 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
NFATC3-210ENST00000562171 OSCARQ8IYS5 282 aa37.65■■■■□ 3.62
NFATC3-210ENST00000562171 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
NFATC3-210ENST00000562171 CUX1P39880 1505 aa37.56■■■■□ 3.6
NFATC3-210ENST00000562171 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.55■■■■□ 3.6
NFATC3-210ENST00000562171 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.54■■■■□ 3.64e-9■■■□□ 16.1
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NFATC3-210ENST00000562171 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.52■■■■□ 3.6
NFATC3-210ENST00000562171 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
NFATC3-210ENST00000562171 WDR97A6NE52 1622 aa37.29■■■■□ 3.56
NFATC3-210ENST00000562171 TRIM41Q8WV44 630 aa37.29■■■■□ 3.56
NFATC3-210ENST00000562171 CHD1O14646 1710 aa37.24■■■■□ 3.55
NFATC3-210ENST00000562171 FBLN2P98095 1184 aa37.2■■■■□ 3.55
NFATC3-210ENST00000562171 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.17■■■■□ 3.54
NFATC3-210ENST00000562171 GRIN2BQ13224 1484 aa37.14■■■■□ 3.54
NFATC3-210ENST00000562171 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.13■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.13■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
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NFATC3-210ENST00000562171 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.09■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 TOP2BQ02880 1626 aa37.09■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.09■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.08■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.07■■■■□ 3.53
NFATC3-210ENST00000562171 SYNJ1O43426 1573 aa37.07■■■■□ 3.52
NFATC3-210ENST00000562171 ARHGEF11O15085 1522 aa37.04■■■■□ 3.52
NFATC3-210ENST00000562171 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.01■■■■□ 3.52
NFATC3-210ENST00000562171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
NFATC3-210ENST00000562171 PBRM1Q86U86 1689 aa37■■■■□ 3.51
NFATC3-210ENST00000562171 SYNJ2O15056 1496 aa36.96■■■■□ 3.51
NFATC3-210ENST00000562171 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.85■■■■□ 3.49
NFATC3-210ENST00000562171 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.74■■■■□ 3.47
NFATC3-210ENST00000562171 ARAP1Q96P48 1450 aa36.71■■■■□ 3.47
NFATC3-210ENST00000562171 ADAMTS12P58397 1594 aa36.7■■■■□ 3.46
NFATC3-210ENST00000562171 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.66■■■■□ 3.46
NFATC3-210ENST00000562171 GRIN2AQ12879 1464 aa36.66■■■■□ 3.46
NFATC3-210ENST00000562171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.63■■■■□ 3.45
NFATC3-210ENST00000562171 NUP160Q12769 1436 aa36.52■■■■□ 3.44
NFATC3-210ENST00000562171 CEP170Q5SW79 1584 aa36.51■■■■□ 3.44
NFATC3-210ENST00000562171 KIF27Q86VH2 1401 aa36.39■■■■□ 3.42
NFATC3-210ENST00000562171 IGF1RP08069 1367 aa36.33■■■■□ 3.41
NFATC3-210ENST00000562171 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.32■■■■□ 3.4
NFATC3-210ENST00000562171 SHROOM2Q13796 1616 aa36.3■■■■□ 3.4
NFATC3-210ENST00000562171 CUL7Q14999 1698 aa36.21■■■■□ 3.39
NFATC3-210ENST00000562171 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
NFATC3-210ENST00000562171 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.17■■■■□ 3.38
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