Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPG1Q9Y678 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPG1Q9Y678 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPG1Q9Y678 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms