Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF12Q9Y4X4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms