Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP11Q9Y3A2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP11Q9Y3A2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms