Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX4Q9Y2E6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX4Q9Y2E6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX4Q9Y2E6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms