Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRPC6Q9Y210 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC6Q9Y210 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms