Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC9Q9UKV0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC9Q9UKV0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC9Q9UKV0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC9Q9UKV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms