Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms