Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCOR3Q9P2K3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCOR3Q9P2K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms