Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
USP35Q9P2H5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP35Q9P2H5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
USP35Q9P2H5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
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