Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0K8

FOXJ2, Forkhead box protein J2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ2Q9P0K8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ2Q9P0K8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXJ2Q9P0K8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ2Q9P0K8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ2Q9P0K8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms