Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXL2Q9NZ53 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PODXL2Q9NZ53 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms