Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMSN1Q9NSI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMSN1Q9NSI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms