Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD1Q9NS62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD1Q9NS62 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms