Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM167BQ9NRX6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM167BQ9NRX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms