Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO8Q9NRD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO8Q9NRD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO8Q9NRD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms