Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GPHNQ9NQX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPHNQ9NQX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms