Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASS4Q9NQ75 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASS4Q9NQ75 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASS4Q9NQ75 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms