Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC40A1Q9NP59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC40A1Q9NP59 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms