Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCIF1Q9H4Z3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCIF1Q9H4Z3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCIF1Q9H4Z3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms