Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6CQ9H3T2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6CQ9H3T2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms