Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R0

KDM4C, Lysine-specific demethylase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4CQ9H3R0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM4CQ9H3R0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4CQ9H3R0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4CQ9H3R0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms