Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC113Q9H0I3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC113Q9H0I3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.4 ms