Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK3Q9C098 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCLK3Q9C098 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK3Q9C098 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms