Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF3BQ9BZI7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF3BQ9BZI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPF3BQ9BZI7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms