Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL4Q9BYD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL4Q9BYD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL4Q9BYD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms