Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PACSIN1Q9BY11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACSIN1Q9BY11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACSIN1Q9BY11 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms