Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNRNP25Q9BV90 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25Q9BV90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25Q9BV90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms