Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAF11Q99590 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF11Q99590 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF11Q99590 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms