Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RUFY1Q96T51 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY1Q96T51 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms