Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCNAQ96QF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCNAQ96QF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCNAQ96QF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms