Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOX2Q96NM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOX2Q96NM4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOX2Q96NM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms