Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM71F1Q96KD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM71F1Q96KD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM71F1Q96KD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms